Situada al norte del conjunto, la iglesia cierra por este lado el recinto, incorporando al sistema defensivo la torre y los ábsides. A los pies está adosada la casa abadía y, al sur, separado por una tapia, el cementerio.

Está construida en sillarejo de piedra caliza.

Presenta nave única de grandes dimensiones con dos capillas laterales y cabecera de tres ábsides, construidos sobre una cripta, comunicados entre sí y con el frente cerrado los laterales, de forma que queda abierto a la nave únicamente el ábside central.

Su disposición sobre el terreno abrupto permite la presencia de la cripta a un nivel inferior. Tuvo acceso desde ambos lados de la nave, estando actualmente practicable únicamente el del lado de la Epístola. Está formada por tres ábsides de escasa altura, precedidos de tramos rectos, quedando comunicados por un corredor transversal; los tramos rectos se cubren con bóveda de cañón y los ábsides con cuarto de esfera.

La nave se cubre con bóveda de cañón, igual que los tramos rectos que anteceden a los ábsides, y estos lo hacen con cuarto de esfera. La nave se amplió con una capilla a cada lado, a las que se cubrió con bóveda de cañón; a los pies se colocó un coro de madera sobre arco rebajado y comunicado con la abadía.

Abren vanos de medio punto con doble derrame para la cabecera de la nave y aspillerados para iluminar la cripta.

Tiene sacristía a la que se accede desde el presbiterio sur. 

La nave y capillas laterales se decoraron en el siglo XVIII con pinturas murales, como muchas de las iglesias del Sobrarbe. El programa iconográfico insiste en motivos comunes (Sagrado Corazón, Eucaristía, escenas de la Pasión...) que parecen responder a un programa de evangelización del obispado de Barbastro sobre ciertos dogmas. Del mismo modo se repiten otros motivos decorativos como floreros, rocallas...

La puerta de la iglesia abre al sur en arco de medio punto, sobre cuya clave hay una inscripción con la fecha de 1527. De ejecución posterior es el pórtico con bóveda de medio cañón, fechado en 1723.

La torre es de mampostería con sillares en las esquinas, planta rectangular y un solo cuerpo. Se levanta sobre el presbiterio sur, desde el que se accede. Cierra con bóveda esquifada que al exterior está rematada por un pretil almenado sobre línea de imposta corrida. Existe otro acceso exterior sobre el tejado de la sacristía. Tiene dos vanos para campanas al este y uno en los restantes lados.